Подклапанный аортальный стеноз бывает двух типов — мембранозного и мышечного. В результате повреждающего действия струи крови, бьющей через стенотическое отверстие по створкам клапана, последние утолщаются и деформируются, что может вести к аортальной недостаточности. С уверенностью отличить подклапанный аортальный стеноз от клапанного по клиническим признакам нельзя. Тем не менее при подклапанном стенозе редко бывает тон изгнания, часто слышен диастолический шум аортальной недостаточности, обычно не пальпируется дрожание в яремной ямке, а расширение восходящей аорты хотя и встречается, но менее выражено, чем при клапанном аортальном стенозе.

ЭхоКГ позволяет определить тип подклапанного стеноза, толщину и расположение препятствия. Подклапанному стенозу может сопутствовать гипоплазия аортального кольца. Движение створок аортального клапана может быть неправильным из-за нарушения кровотока: створки открываются нормально, но в середине систолы частично захлопываются. Дифференциальный диагноз между клапанным и подклапанным стенозом проводят при помощи ЭхоКГ, реже прибегают к рентгеноконтрастному исследованию сердца; выявить подклапанный стеноз очень важно, поскольку хирургическое удаление подклананной обструкции дает очень хорошие результаты, а ее сохранение ведет к повреждению створок аортального клапана и его прогрессирующей недостаточности. В некоторых случаях подкапанная обструкция возникает из-за аномально расположении сосочковой мышцы или смещенного митрального клапана. этом случае хирургическая коррекция затруднена и может осложниться митральной недостаточностью.